MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 29248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019942	TAT	2	6	299671	299676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432328259
6002	NC_019942	CCT	2	6	299679	299684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328259
6003	NC_019942	CCCCT	2	10	299718	299727	0 %	20 %	0 %	80 %	432328259
6004	NC_019942	GCG	2	6	299791	299796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432328259
6005	NC_019942	AGA	3	9	299821	299829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328259
6006	NC_019942	CTG	2	6	299854	299859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328259
6007	NC_019942	GA	3	6	299910	299915	50 %	0 %	50 %	0 %	432328259
6008	NC_019942	TC	3	6	299922	299927	0 %	50 %	0 %	50 %	432328259
6009	NC_019942	TC	3	6	299937	299942	0 %	50 %	0 %	50 %	432328259
6010	NC_019942	ATA	2	6	299951	299956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328259
6011	NC_019942	TCT	2	6	299981	299986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_019942	ATAA	2	8	299998	300005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_019942	ATGC	2	8	300012	300019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_019942	GCAA	2	8	300172	300179	50 %	0 %	25 %	25 %	432328260
6015	NC_019942	GAT	2	6	300216	300221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328260
6016	NC_019942	GAG	2	6	300267	300272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328260
6017	NC_019942	CCT	2	6	300335	300340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328260
6018	NC_019942	ATC	2	6	300361	300366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328260
6019	NC_019942	CTT	2	6	300382	300387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328260
6020	NC_019942	ATG	3	9	300409	300417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328260
6021	NC_019942	TACGG	2	10	300523	300532	20 %	20 %	40 %	20 %	432328260
6022	NC_019942	TCA	2	6	300566	300571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328260
6023	NC_019942	AGC	2	6	300582	300587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432328260
6024	NC_019942	CCT	2	6	300588	300593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328260
6025	NC_019942	A	6	6	300667	300672	100 %	0 %	0 %	0 %	432328260
6026	NC_019942	CCT	2	6	300773	300778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328260
6027	NC_019942	TTG	2	6	300827	300832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432328260
6028	NC_019942	AG	3	6	300870	300875	50 %	0 %	50 %	0 %	432328260
6029	NC_019942	GCA	2	6	300901	300906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432328260
6030	NC_019942	CAGC	2	8	300987	300994	25 %	0 %	25 %	50 %	432328260
6031	NC_019942	CATA	2	8	301073	301080	50 %	25 %	0 %	25 %	432328260
6032	NC_019942	AGG	2	6	301104	301109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328260
6033	NC_019942	GTT	2	6	301134	301139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432328260
6034	NC_019942	GGA	2	6	301171	301176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328260
6035	NC_019942	TCT	2	6	301188	301193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328260
6036	NC_019942	G	6	6	301318	301323	0 %	0 %	100 %	0 %	432328261
6037	NC_019942	ACC	2	6	301375	301380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432328261
6038	NC_019942	AG	3	6	301708	301713	50 %	0 %	50 %	0 %	432328261
6039	NC_019942	CAC	2	6	301755	301760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432328261
6040	NC_019942	CTT	2	6	301762	301767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328261
6041	NC_019942	CTT	2	6	301777	301782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328261
6042	NC_019942	CAG	2	6	301790	301795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432328261
6043	NC_019942	GGA	2	6	301815	301820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328261
6044	NC_019942	ATA	2	6	301837	301842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328261
6045	NC_019942	GA	3	6	301858	301863	50 %	0 %	50 %	0 %	432328261
6046	NC_019942	TAA	2	6	301892	301897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328261
6047	NC_019942	CTT	2	6	301960	301965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328261
6048	NC_019942	AT	3	6	302118	302123	50 %	50 %	0 %	0 %	432328262
6049	NC_019942	TCC	2	6	302159	302164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328262
6050	NC_019942	TTC	2	6	302228	302233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328262
6051	NC_019942	CAA	2	6	302304	302309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328262
6052	NC_019942	AGAT	2	8	302331	302338	50 %	25 %	25 %	0 %	432328262
6053	NC_019942	AAG	2	6	302363	302368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328262
6054	NC_019942	ATA	2	6	302486	302491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328262
6055	NC_019942	ATG	2	6	302528	302533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328262
6056	NC_019942	TGA	2	6	302545	302550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328262
6057	NC_019942	GGAGG	2	10	302564	302573	20 %	0 %	80 %	0 %	432328262
6058	NC_019942	GTG	2	6	302636	302641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432328263
6059	NC_019942	TGGAG	2	10	302832	302841	20 %	20 %	60 %	0 %	432328263
6060	NC_019942	TAC	2	6	302842	302847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328263
6061	NC_019942	GAG	2	6	302890	302895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328263
6062	NC_019942	AAGA	2	8	302928	302935	75 %	0 %	25 %	0 %	432328263
6063	NC_019942	GA	3	6	302934	302939	50 %	0 %	50 %	0 %	432328263
6064	NC_019942	AGG	2	6	302945	302950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328263
6065	NC_019942	CTT	2	6	303027	303032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328263
6066	NC_019942	GGA	2	6	303157	303162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328263
6067	NC_019942	GAG	2	6	303166	303171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328263
6068	NC_019942	GAGATG	2	12	303190	303201	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	432328263
6069	NC_019942	AG	3	6	303203	303208	50 %	0 %	50 %	0 %	432328263
6070	NC_019942	CTG	2	6	303232	303237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328263
6071	NC_019942	AAG	2	6	303241	303246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328263
6072	NC_019942	GAG	2	6	303331	303336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328264
6073	NC_019942	CAT	2	6	303424	303429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328264
6074	NC_019942	GAG	2	6	303449	303454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328264
6075	NC_019942	CAA	2	6	303534	303539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328264
6076	NC_019942	GGA	2	6	303577	303582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328264
6077	NC_019942	GTG	2	6	303590	303595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432328264
6078	NC_019942	AAG	2	6	303619	303624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328264
6079	NC_019942	GCAA	2	8	303698	303705	50 %	0 %	25 %	25 %	432328264
6080	NC_019942	GGC	2	6	303709	303714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432328264
6081	NC_019942	ATA	2	6	303723	303728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328264
6082	NC_019942	GGT	2	6	303793	303798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432328264
6083	NC_019942	CAG	2	6	303803	303808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432328264
6084	NC_019942	AAT	2	6	303892	303897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328264
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6086	NC_019942	A	6	6	304035	304040	100 %	0 %	0 %	0 %	432328264
6087	NC_019942	GAA	2	6	304139	304144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328264
6088	NC_019942	TCCA	2	8	304168	304175	25 %	25 %	0 %	50 %	432328264
6089	NC_019942	ATA	2	6	304308	304313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328264
6090	NC_019942	AGG	2	6	304341	304346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328264
6091	NC_019942	AGGA	2	8	304358	304365	50 %	0 %	50 %	0 %	432328264
6092	NC_019942	GAG	2	6	304390	304395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328264
6093	NC_019942	TGA	2	6	304465	304470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328265
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6096	NC_019942	GC	3	6	304560	304565	0 %	0 %	50 %	50 %	432328265
6097	NC_019942	AAC	2	6	304622	304627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328265
6098	NC_019942	TAT	2	6	304685	304690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432328265
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6103	NC_019942	GATG	2	8	304861	304868	25 %	25 %	50 %	0 %	432328265
6104	NC_019942	GAG	2	6	304913	304918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328265
6105	NC_019942	GGA	2	6	305044	305049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328265
6106	NC_019942	ATG	2	6	305274	305279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328265
6107	NC_019942	GAA	2	6	305286	305291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328265
6108	NC_019942	GA	4	8	305356	305363	50 %	0 %	50 %	0 %	432328266
6109	NC_019942	TTC	2	6	305440	305445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328266
6110	NC_019942	ATG	2	6	305470	305475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328266
6111	NC_019942	GCC	2	6	305482	305487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432328266
6112	NC_019942	CAT	3	9	305519	305527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328266
6113	NC_019942	TTG	2	6	305603	305608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432328266
6114	NC_019942	GGC	2	6	305617	305622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432328266
6115	NC_019942	GCATC	2	10	305644	305653	20 %	20 %	20 %	40 %	432328266
6116	NC_019942	GAT	2	6	305655	305660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328266
6117	NC_019942	TGA	2	6	305675	305680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328266
6118	NC_019942	TAA	2	6	305738	305743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328266
6119	NC_019942	GA	3	6	305847	305852	50 %	0 %	50 %	0 %	432328266
6120	NC_019942	GGA	2	6	305856	305861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328266
6121	NC_019942	TCT	2	6	305901	305906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328266
6122	NC_019942	GCA	2	6	305998	306003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432328266
6123	NC_019942	GGA	2	6	306030	306035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328266
6124	NC_019942	ATG	2	6	306118	306123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328266
6125	NC_019942	GAA	2	6	306134	306139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328266
6126	NC_019942	CTC	2	6	306157	306162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328266
6127	NC_019942	GAT	2	6	306178	306183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328266
6128	NC_019942	TCCT	2	8	306208	306215	0 %	50 %	0 %	50 %	432328266
6129	NC_019942	AGG	2	6	306218	306223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328266
6130	NC_019942	TGT	2	6	306503	306508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432328267
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6132	NC_019942	TGA	2	6	306680	306685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328267
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6134	NC_019942	GAT	2	6	306896	306901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328267
6135	NC_019942	AGGA	2	8	306967	306974	50 %	0 %	50 %	0 %	432328267
6136	NC_019942	GAA	2	6	306977	306982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328267
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6139	NC_019942	AT	3	6	307131	307136	50 %	50 %	0 %	0 %	432328268
6140	NC_019942	GA	3	6	307177	307182	50 %	0 %	50 %	0 %	432328268
6141	NC_019942	TGA	2	6	307199	307204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328268
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6143	NC_019942	AG	3	6	307323	307328	50 %	0 %	50 %	0 %	432328268
6144	NC_019942	GCT	2	6	307342	307347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328268
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6147	NC_019942	AT	3	6	307521	307526	50 %	50 %	0 %	0 %	432328268
6148	NC_019942	AGTGG	2	10	307540	307549	20 %	20 %	60 %	0 %	432328268
6149	NC_019942	AT	3	6	307574	307579	50 %	50 %	0 %	0 %	432328268
6150	NC_019942	GATA	2	8	307636	307643	50 %	25 %	25 %	0 %	432328268
6151	NC_019942	TGC	2	6	307685	307690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328268
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6155	NC_019942	TCTG	2	8	307827	307834	0 %	50 %	25 %	25 %	432328268
6156	NC_019942	CAA	2	6	307853	307858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328268
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6158	NC_019942	AT	4	8	307957	307964	50 %	50 %	0 %	0 %	432328268
6159	NC_019942	A	6	6	307974	307979	100 %	0 %	0 %	0 %	432328268
6160	NC_019942	ATT	3	9	308065	308073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432328268
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6165	NC_019942	TA	3	6	308316	308321	50 %	50 %	0 %	0 %	432328268
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6179	NC_019942	TGG	2	6	309161	309166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432328269
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6184	NC_019942	ATC	2	6	309527	309532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328270
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6209	NC_019942	CACCT	2	10	310925	310934	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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6212	NC_019942	CTT	2	6	311027	311032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6215	NC_019942	TAT	2	6	311146	311151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6216	NC_019942	T	6	6	311251	311256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6217	NC_019942	ATT	2	6	311328	311333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6218	NC_019942	ACATA	2	10	311353	311362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6219	NC_019942	GGT	2	6	311375	311380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6220	NC_019942	ATT	2	6	311478	311483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6221	NC_019942	GAATA	2	10	311486	311495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6222	NC_019942	AC	3	6	311538	311543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6223	NC_019942	TTA	2	6	311578	311583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6224	NC_019942	GAT	2	6	311592	311597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6233	NC_019942	A	6	6	312058	312063	100 %	0 %	0 %	0 %	432328271
6234	NC_019942	CT	3	6	312106	312111	0 %	50 %	0 %	50 %	432328271
6235	NC_019942	CAT	2	6	312219	312224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328272
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6237	NC_019942	GTCTCC	2	12	312338	312349	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	432328272
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6240	NC_019942	AAC	2	6	312466	312471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328272
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6243	NC_019942	T	6	6	312569	312574	0 %	100 %	0 %	0 %	432328272
6244	NC_019942	TATG	2	8	312598	312605	25 %	50 %	25 %	0 %	432328272
6245	NC_019942	CTATG	2	10	312657	312666	20 %	40 %	20 %	20 %	432328272
6246	NC_019942	ATA	2	6	312685	312690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328272
6247	NC_019942	AGGA	2	8	312721	312728	50 %	0 %	50 %	0 %	432328272
6248	NC_019942	CCA	4	12	312773	312784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432328272
6249	NC_019942	ATT	2	6	312860	312865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432328272
6250	NC_019942	CGT	2	6	312882	312887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328272
6251	NC_019942	GTTA	2	8	312967	312974	25 %	50 %	25 %	0 %	432328272
6252	NC_019942	TGC	2	6	312982	312987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328272
6253	NC_019942	ATC	2	6	312994	312999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328272
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6283	NC_019942	GGT	2	6	315054	315059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432328274
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6297	NC_019942	A	6	6	315627	315632	100 %	0 %	0 %	0 %	432328274
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6355	NC_019942	AGATCA	2	12	319068	319079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	432328278
6356	NC_019942	ACC	2	6	319151	319156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6357	NC_019942	ATA	2	6	319167	319172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6358	NC_019942	CAA	2	6	319238	319243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328279
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6360	NC_019942	GGA	2	6	319302	319307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328279
6361	NC_019942	CTT	2	6	319311	319316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328279
6362	NC_019942	TTC	3	9	319327	319335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328279
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6364	NC_019942	TC	3	6	319362	319367	0 %	50 %	0 %	50 %	432328279
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6369	NC_019942	CCTTC	2	10	319649	319658	0 %	40 %	0 %	60 %	432328279
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6372	NC_019942	T	6	6	319729	319734	0 %	100 %	0 %	0 %	432328279
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6492	NC_019942	TA	4	8	324227	324234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6493	NC_019942	TA	5	10	324236	324245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6494	NC_019942	TA	3	6	324247	324252	50 %	50 %	0 %	0 %	432328284
6495	NC_019942	AGT	2	6	324281	324286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328284
6496	NC_019942	TTTA	2	8	324321	324328	25 %	75 %	0 %	0 %	432328284
6497	NC_019942	AT	3	6	324345	324350	50 %	50 %	0 %	0 %	432328284
6498	NC_019942	CCA	2	6	324394	324399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432328284
6499	NC_019942	AAC	2	6	324414	324419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328284
6500	NC_019942	ATA	2	6	324423	324428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328284

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